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Etude Metagenomique Fonctionnelle de la Rhizosphère d'Erica Andevale

Audience : Adulte - Grand Public
Le Pitch
PrésentationDernièrement, la metagenomique est apparue comme une alternative aux méthodes conventionnelles de screening microbiologique, puisqu'elle permet d'étudier d'une manière exhaustive les communautés microbiennes dans leur entourage naturel. Ici, on a utilisé cette technique pour évaluer l'extension et la diversité des mécanismes de résistance des communautés microbiennes associées à la rhizosphère d' Erica andevalensis, bruyère extremophile et endémique de la rivière Rio Tinto, Espagne. Pour cela on a construit une librairie metagenomique á base du plasmide pBluescript SKII+ comme vecteur de clonage, acceptant des inserts dont la taille peut varier entre 2500pb et 8000pb (paire de base). Notre librairie comprenait 60000 clones, auxquels nos avons soumis á la sélection de quatre antibiotiques : l'acide nalidixique, la tétracycline, la streptomycine et la kanamycine. Contre ce derniers, nous avons isolé un clone résistant avec une CMI = 10 g/ml. Le séquençage de l'insert et son analyse bioinformatique ultérieure a révélé qu'il s'agit d'un aminoglycoside phosphotransferase APH III qui agit par désactivation par phosphorisation de l'antibiotique. Afficher moinsAfficher plus

Etude Metagenomique Fonctionnelle de la Rhizosphère d'Erica Andevale

39,90 €
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39,90 €

Le Pitch

PrésentationDernièrement, la metagenomique est apparue comme une alternative aux méthodes conventionnelles de screening microbiologique, puisqu'elle permet d'étudier d'une manière exhaustive les communautés microbiennes dans leur entourage naturel. Ici, on a utilisé cette technique pour évaluer l'extension et la diversité des mécanismes de résistance des communautés microbiennes associées à la rhizosphère d' Erica andevalensis, bruyère extremophile et endémique de la rivière Rio Tinto, Espagne. Pour cela on a construit une librairie metagenomique á base du plasmide pBluescript SKII+ comme vecteur de clonage, acceptant des inserts dont la taille peut varier entre 2500pb et 8000pb (paire de base). Notre librairie comprenait 60000 clones, auxquels nos avons soumis á la sélection de quatre antibiotiques : l'acide nalidixique, la tétracycline, la streptomycine et la kanamycine. Contre ce derniers, nous avons isolé un clone résistant avec une CMI = 10 g/ml. Le séquençage de l'insert et son analyse bioinformatique ultérieure a révélé qu'il s'agit d'un aminoglycoside phosphotransferase APH III qui agit par désactivation par phosphorisation de l'antibiotique. Afficher moinsAfficher plus

Détails du livre

Titre complet
Etude Metagenomique Fonctionnelle de la Rhizosphère d’Erica Andevale: à la recherche de Gènes de Resistance à Antibiotiques
Format
Broché
Publication
01 juillet 2018
Audience
Adulte - Grand Public
Pages
52
Taille
22.9 x 15.2 x 0.3 cm
Poids
92
ISBN-13
9786138398271
Livré entre : 31 juillet - 5 août
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