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Jaspard, Emmanuel

Bioinformatique avec Python et Biopython

  • Bioinformatique avec Python et Biopython
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Audience : Adulte - Universitaire
Le Pitch
PrésentationLa bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. L’objectif de  cet ouvrage est de montrer par l’exemple des scripts Python et Biopython et  d’établir un lien avec le concept biologique afférent, afin que le lecteur puisse  développer ses propres scripts ou adapter ceux existants. Le langage Python, par sa simplicité d’apprentissage, est particulièrement  utilisé pour développer des applications. Biopython est un ensemble de scripts  et d’outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et  des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.,SommaireDénombrement des nucléotides et calculs associés.Écriture de séquences d’acides nucléiques.Séquences et expressions régulières.Recherches bibliographiques dans PubMed.Profil PFAM d’une famille de protéines.Profil d’hydrophobicité d’une protéine– fenêtre de taille variable.Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure.Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée.Diagrammes de Ramachandran.Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D.Superposition de structures protéiques.Les protéines ou régions intrinsèquement désordonnées.Alignements avec BLAST de séquences et protéines homologues. Afficher moinsAfficher plus

Jaspard, Emmanuel

Bioinformatique avec Python et Biopython

22,00 €
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Le Pitch

PrésentationLa bioinformatique est une discipline essentielle de la biologie. L’objectif de  cet ouvrage est de montrer par l’exemple des scripts Python et Biopython et  d’établir un lien avec le concept biologique afférent, afin que le lecteur puisse  développer ses propres scripts ou adapter ceux existants. Le langage Python, par sa simplicité d’apprentissage, est particulièrement  utilisé pour développer des applications. Biopython est un ensemble de scripts  et d’outils, librement disponibles, permettant de développer des bibliothèques et  des applications Python pour les besoins des travaux en bioinformatique.,SommaireDénombrement des nucléotides et calculs associés.Écriture de séquences d’acides nucléiques.Séquences et expressions régulières.Recherches bibliographiques dans PubMed.Profil PFAM d’une famille de protéines.Profil d’hydrophobicité d’une protéine– fenêtre de taille variable.Position de cystéines impliquées dans un pont disulfure.Calcul du barycentre d’une chaîne polypeptidique repliée.Diagrammes de Ramachandran.Contacts entre résidus d’acides aminés dans les structures 3D.Superposition de structures protéiques.Les protéines ou régions intrinsèquement désordonnées.Alignements avec BLAST de séquences et protéines homologues. Afficher moinsAfficher plus

Détails du livre

Titre complet
Bioinformatique avec Python et Biopython
Auteur
Jaspard, Emmanuel
Editeur
DUNOD
Format
Grand Format
Publication
03 janvier 2024
Auteur
Hunault, Gilles
Audience
Adulte - Universitaire
Pages
224
Taille
24 x 16.9 x 1.3 cm
Poids
390
ISBN-13
9782100858873

Auteur

Jaspard, Emmanuel
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Livré entre : 15 juin - 20 juin
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